战略层卫生部的职能包括为国家公共卫生服务建立政策框架,制定国家标准和长远发展计划,确保资源合理配置。卫生保护局是2003年4月1日新成立的非部门公共实体,它是由卫生部大臣许可成立的独立的跨部门组织,主要目标是保障国民健康,减少传染病、化学危害、毒物和放射性物质危害的影响,召集卫生专家。同时,新成立的卫生保护局还接管了原公共卫生实验室的国家传染病监测中心和国家公共卫生实验室,形成了高度完善的传染病监控系统。传染病监测中心还设有国家和区域两个层次公共卫生实验室,国家公共卫生实验室主要是为区域公共卫生实验室、NHS医院实验室、传染病控制顾问、社区和医院的医师、环境卫生官员等提供专业知识和建议。
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