DNA作为遗传信息的载体,以双螺旋的形式存在于细胞核内,在细胞子代的繁衍过程中其碱基序列始终保持不变,因此在测定基因组的DNA序列时不需要考虑时空的影响。而在蛋白质组的研究中,时间和空间的影响都是不可忽略的。对于在不同时间过程中蛋白质组的组成成分的比较分析— — —差异蛋白质组研究,已成为当前蛋白质组学的主要内容。这种亚细胞蛋白质组可能是细胞器蛋白质组,如高尔基体蛋白质组。然而,整个细胞或组织的蛋白组成极其复杂,直接对其进行蛋白质组学分析,往往会丢掉很多蛋白质信息,由此衍生出了亚细胞蛋白质组学。亚细胞蛋白质组的完整研究策略总结如图1‐8‐1。
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