化合物的极性:手性固定相与对映体间的氢键作用有利于手性拆分,因此,极性强的化合物比极性弱的化合物更易分离。对某些化合物进行衍生化处理,引入合适的基团,可增加氢键作用和降低沸点。如在二肽酯类固定相上,2‐羟基羧酰胺衍生物对映体比酯衍生物对映体的分离度更大。各种氨基酸衍生物的极性和挥发性不同,因而与手性固定相的氢键作用也不同,它们从色谱柱上被洗脱的温度范围很宽。若一次分析多种氨基酸,纯氨基酸衍生物类固定相由于其热稳定性较差,是不太合适的。