孤独症儿童脑电图异常率可达20%~80%,大多为广泛性异常,表现为慢波增多。国内一项对115例孤独症儿童临床脑电图的检查结果进行统计分析,发现异常脑电图52例(45.2%)。另有研究发现孤独症患儿脑电图清醒状态多表现为弥散性异常,而在睡眠状态则表现为正常,从病因上推测为大脑有实质性弥漫性损伤。一项研究发现与正常儿童相比较,孤独症患儿MMN波形变异较大,孤独症患儿MMN潜伏期后移,波幅降低,提示孤独症患儿存在认知加工过程的缓慢。