医院感染在临床上既具有一般感染的特点,又具有不典型性、隐蔽性的特点。如患者的基础疾病和原有感染掩盖医院感染的症状体征,免疫功能低下患者发生感染时症状体征可以不典型,甚至可以缺如临床表现,实验室检查和影像学检查也可以不典型,甚至缺如。这些都增加了及时发现医院感染和诊断医院感染的难度。同时医院感染诊断还可以借助病理学检查,如非结核分枝杆菌感染、肺部真菌感染时,组织病理学检查具有重要意义,可以弥补病原学检查需要时间长,存在假阴性或假阳性的不足。