多糖的纯度标准不能用通常化合物的纯度标准来衡量,因为即使是多糖纯品,其微观也是不均一的,它的纯度只代表某一多糖的相似链长的平均配布。纯度的概念是随着分离分析手段的进展而不断发展的,当一种方法已不能将某种样品进一步分离时,即称为该方法下纯的样品。例如,色谱纯、电泳纯和超离心分析纯等。我们通常所说的多糖纯品实质上是一定分子量范围的均一组分。目前常用的纯度鉴定方法有三种:超离心、高压电泳及凝胶色谱,也有人将旋光测定作为一种纯度鉴定的标准,通常一种多糖的均一性必须要有上述两种以上方法的鉴定结果才能肯定。凝胶色谱已被愈来愈多的人所利用,原因是准确度高,多糖经凝胶色谱得到一对称峰,则证明该多糖是均一组分。
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