[速览]七、亚细胞蛋白质组学的挑战和展望

亚细胞蛋白质组首要的挑战就是整个蛋白质组学的挑战，即低丰度蛋白和膜蛋白的鉴定，在此毋庸多说。所以，今后亚细胞蛋白质组学有很大的发展空间，一方面更多地鉴定蛋白质，更重要、更应该关注的是阐述这些蛋白的定位或功能，在这种细胞结构中发挥怎样的作用，解释鉴定出来的蛋白质是来自于其他亚细胞结构还是发生了定位变化。因为整个细胞的蛋白质组很复杂，分析亚细胞结构蛋白质组可以降低复杂度，可能会使一些相对低丰度的蛋白质得到呈现，而且可以提示亚细胞定位和功能信息，从而发现更多的和可能更有意义的差异蛋白质。