疟原虫生活史有多个时期,每个生活史期有多种抗原,而且每种抗原具有多个表位,有些抗原还有多个等位基因,相同抗原又有多种结构形式,免疫系统有多种作用因子,而不同宿主的免疫反应也不相同,所有的这些因素给疟疾疫苗的研制带来了许多困难。从现有的疟疾疫苗看,疟疾的第一代疫苗— — —全虫减毒活疫苗激发的免疫反应低下,临床试验效果不佳。核酸疫苗被看成是极具发展潜力的第三代疫苗。