用于制备DNA疫苗的质粒通常是非复制型的表达质粒,它在宿主细胞内的表达水平与调控DNA表达的启动子关系密切。不同的启动子在不同的机体组织中调控表达的水平可以显著不同,而表达水平的不同又直接影响着免疫应答的强度和持续性。因此,启动子类型直接影响质粒DNA在机体内表达外源蛋白水平,是DNA免疫应答的主要影响因素之一。例如,在HBV DNA免疫中,以HBsAg基因自身的启动子取代CMV(pHBV‐S2.S)能诱导C57BL/6小鼠产生较高效介的抗‐HBS。