下面是感兴趣的斑点的选择、从凝胶上切下蛋白斑点。这一步可用市售的斑点铲手工或自动进行。在电泳得出结果和靶蛋白的消化之间的阶段,样本处理得不好,角蛋白污染就会进入到工作过程。甚至在单独使用染色斑点时都要用到分光光度计分析。下面介绍污染许多谱系的源于四种角蛋白的多肽,通常观察到的源于四种角蛋白的胰蛋白酶多肽被列于下表:人K2C1角蛋白,型细胞骨架1(K1皮肤)分子量:65847.手工过程:戴上有滑石粉的手套,用一干净的手术刀把感兴趣的蛋白斑点沿周围切下,尽可能小地切下斑点胶,用外科针把切下的凝胶块移到预先洗过的500ul的eppendorf管中。
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