第四节 数据库搜索

在分子生物学研究中，对于新测定的碱基序列或氨基酸序列，人们往往试图通过数据库搜索找出与其相似的序列，以推测该未知序列是否与已知序列同源，或可能属于哪个基因家族，以及具有哪些生物功能。例如，对氨基酸序列来说，有可能找到已知的同源蛋白质，从而由已知蛋白质的三维结构推测未知蛋白质的空间结构。新测定的、希望通过数据库搜索确定其性质或功能的序列称作探测序列（probe sequence），通过数据库搜索得到的和探测序列具有一定相似性的序列称目标序列（subject sequence）。图2-14使用PAM30矩阵B ......