我国乙肝病毒(HBV)感染者占全世界的1/3,约有1.2亿人长期携带HBV,慢性乙肝患者超过3000万。HBV持续感染导致慢性活动型肝炎和肝硬化,是肝细胞癌(HCC)最主要的危险因素。本章通过实例阐述遗传流行病学方法研究乙肝相关性肝细胞癌,识别和估计肝癌家庭集聚性,应用分离分析确定遗传模式,应用遗传学位标进行连锁分析,论述了部分HCC相关基因分子流行病学方法,为利用我国丰富的遗传学资源研究我国HBV及其相关肝脏疾病。