众多的研究资料显示,对传统中药的研究仅根据有效成分的含量测定很难获得中药整体疗效,因此在中药化学成分不明确的情况下,以基本有效成分为基础的指纹图研究能较全面地反映所含成分的相对关系,较好地体现中药成分的复杂性和相对性,从而更发际评价、控制中药质量。中药指纹图谱质量控制方法的局限性还表现在指纹图谱与化学成分之间缺乏相关性,这主要是由于指纹图谱中色谱峰纯度不够所致。中药指纹图谱质量控制方法采用标准指纹图谱作为比对标准,可以因此省去对照品和对照试验的麻烦,这是中药指纹图谱质量控制的一个优点。