[速览]3﹒假阳性和假阴性

酵母双杂交系统在蛋白质组的研究中具有强大的功能。例如，同样是高通量的酵母全蛋白质组的相互作用分析，Uetz和Ito两个工作组得到的结果中只有一小部分（141个蛋白质相互作用对）是重叠的，分别占筛出的相互作用蛋白质对总量的21.6%和16.9%。对于假阳性，可以通过多次重复实验、增加报告基因的数量或者改变报告基因的强度等方法进行改进但也难以完全消除。这些蛋白功能的确定需要免疫共沉淀等生化方法以及衍生的双杂交系统如SRS系统、逆向双杂交系统、split‐ubiquitin系统、RNA聚合酶Ⅲ为基础的双杂交系统等等进行补充。