主要有4个来源:①邻近感染灶蔓延而来,如中耳炎、乳突炎、鼻旁窦(主要是额窦、筛窦)炎、牙周感染等,颞叶、额叶是好发部位。远隔部位感染灶血行播散,如慢性化脓性肺疾病尤其是肺脓肿、支气管扩张症、脓胸、软组织感染、骨髓炎、腹腔感染等,脓肿常呈多灶性和多房性,比来源于邻近部位的脑脓肿有更高的病死率。创伤感染,尤其是战时头颅创伤,由于创口污染和常有异物残留,脑脓肿发生率可高达15%以上。约有20%的脑脓肿找不到明确的原因。偶见毛霉菌脑脓肿,多发生在有其他疾病的重病人,也有开放性颅脑创伤直接引起者。