蛋白质组学方法虽具有独特的优越性,但仍有许多问题和困难,具体表现在以下几方面。随着蛋白质研究数据的不断积累,新方法上的突破和生物信息学工具的完善,蛋白质组学的研究一定能为生命科学的研究、生物技术的应用带来新的革命。我们应该吸收和运用蛋白质组所蕴涵的“整体的”、“动态的”和“联系的”思想方法,来认识基因的功能、蛋白质的存在状态和相互关系。在具体研究对象的选取时,则应该首先着眼于某一种与重要的生命过程、生理功能尤其是病理状态有关的所有蛋白质,以“功能”为纽带,对一个“局部性的整体”加以研究。可以预见,蛋白质组学将对CNS疾病的诊断、监测和新药研发起到无法估量的作用。
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