目前亚细胞蛋白质组研究开展较为广泛,通过对其表达谱分析和差异分析发现和鉴定了一些新的蛋白质。对其他细胞器如线粒体、内质网、高尔基体、过氧化物酶体等多种亚细胞结构都进行了蛋白质组分析。在亚细胞蛋白质组差异表达分析方面,Gemer等发现有TCP‐1a转位到核内。Aderson等对用actinomycin D处理的细胞的核仁蛋白质差异分析发现了11蛋白质缺失。但对于这些差异分析的结果还需借助其他实验以揭示其意义。可以预见亚细胞蛋白质组学的研究特别是不同生理、病理状态下的亚蛋白质组差异分析能够为我们更有效、更快捷地发现有特殊意义的基因表达产物,为更深入理解其生物功能提供重要线索,并为全面展示和分析蛋白质组提供更多信息。
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