不明原因疾病是指短时间或者最初开始调查处理时原因不明的疾病。不明原因”是一个相对的概念,可能是指流行病学原因不明,更多地是指病原学病因不明。由于原因不明,诊断不清,往往以其主要症状表现或者综合征,称为不明原因的发热、腹泻、肺炎、脑炎或肾炎等。即使是原因初步清楚的疾病暴发,也需要进一步核实诊断以及鉴别诊断等,存在被否定或进一步完善的可能,均应按照不明原因疾病暴发调查控制的思路开展现场工作。