人体消化道内的细菌构成1个巨大而复杂的生态系统。消化道的细菌来自空气和食物,胃和小肠的细菌数量较少,从回肠末端,细菌数量开始增多,结肠内最多。厌氧菌为需氧菌的100~10000倍,主要菌种有革兰阴性厌氧类杆菌、梭形杆菌、乳酸杆菌、革兰阳性厌氧芽孢杆菌类、多种厌氧球菌。大肠内的菌群组成在正常情况下是稳定的,微生物之间的相互作用是调节结肠固有菌群的重要因素。肠道菌群还能产生各种物质抑制其他菌种生长,甚至以此作为自身调节的方式,控制自身生长,如大肠菌素和短链脂肪酸等,都具有抑制细菌繁殖的作用。任何抗生素都可导致结肠菌群的改变,这种改变取决于抗生素的抗菌谱及其在肠腔内的浓度。
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