从转基因动物的组织(如尾巴)提取DNA,进行整合检测,可以用PCR与South ern blot相结合的方法进行检测。PCR方法比较简单、快速,也能清楚地检测出低拷贝数的转基因,但是这种方法不能准确地给出转基因的整合位点数,还容易得出假阳性的结果。由于信号的强度与探针的比活度成正比,与其长度成反比,所以,当用非常短的探针时,Southern杂交的灵敏度可达到上限。用Southern blot可以确定动物组织内是否具有目的基因、目的基因是否整合于动物染色体、整合位置、是否发生同源重组、转基因的拷贝数以及分析后代转基因的稳定性。
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