黑甲的主要原因是甲下恶性黑素瘤,常位于拇指或拇趾,特别是白种人发生黑褐色甲线是肿瘤的警报。但在开始阶段或无黑素的肿瘤诊断可能困难。交界痣和甲下恶性黑子也可能会引起单个的色素线。多数纵线见于多发痣细胞痣、Peutz-Jeghers综合征和Addison病。Parlak等曾报道1例白色念珠菌引起黑甲,于晓虹等报道1例热带念珠菌引起黑甲。

褐甲可能是由于应用免疫抑制剂,如环磷酰胺、氟尿嘧啶和博来霉素,色素沉着可以是弥漫的或呈横带状。不很鲜明的褐色变色见于X线治疗和8-甲氧补骨脂素口服光化学疗法之后。

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