隐球菌在神经系统引起的主要病理改变是脑膜炎、脑膜脑炎、肉芽肿和血管炎等,其中脑膜炎最常见,可伴有脑组织充血、水肿及颅压增高等表现的不同病理类型及其进展阶段。亚急性期,随病变进展,隐球菌沿血管周围间隙繁殖、蓄积并向脑深部侵入,在深穿支分布区域的两侧大脑半球深部白质、基底节区、丘脑及中脑被盖等处形成多灶胶状假囊,由于隐球菌产生的酸性粘多糖物质能够缩短T1弛豫时间,故在MRI的T1WI表现为略高或等信号,T2WI呈高信号。慢性期CM,多伴有发热病史,脑脊液检查多有炎性发现。