横向上,保健所与地方政府、警察、消防、医师协会、医疗机构、地方卫生研究所等都建立了横向协调关系。日本在保健所管理体制创新中,导入了弹性的、灵活的运行机制,使保健所组织功能具有适应突发公共卫生事件应急管理所需要的灵活性,如保健所所长的职权,使其能够根据外部环境以及自身专业知识灵活多变地应对和处理突发公共卫生事件。