有效抗病毒药物的发现更加推进了分子生物学和病毒学的发展。在前抗病毒时期,普遍认同的观点是有效干扰病毒复制将破坏病毒复制所依存的宿主细胞。随后,人们越来越认识到宿主细胞与病毒之间相互作用和病毒复制的机制,从而促进了安全有效抗病毒治疗的发展。抗病毒药物的作用在于阻止病毒进入宿主细胞。对阿昔洛韦耐药的病毒株虽对动物模型的致病性减弱,但在HIV感染的患者可以导致重度的、进展性的黏膜疾病,并可能累及内脏。具有免疫力的宿主长期使用阿昔洛韦治疗,偶有阿昔洛韦耐药病毒株引起生殖器疱疹的报道。