一、直接检测特定细菌性病原体的技术：
①循环扩增技术：普通PCR（conventional polymerase chain reaction）、巢式PCR（nested PCR）、半巢式PCR（seminested PCR）、反转录PCR（reverse transcriptionpolymerase chain reaction，RT-PCR）、实时定量PCR （real-time PCR）。②等温扩增技术：包括转录依赖的扩增系统（tran scription-based amplification system，TAS）和链替代扩增反应（strand displacement amplification，SDA）两种不同的方法，其中转录依赖的扩增系统又包括了核酸序列依赖扩增（nucleic acid sequence-based amplification，NASBA）、转录介导的扩增（transcription mediated amplification，TMA）、自主序列复制系统（self-sustained sequence replication，3SR）三种方法。③连接酶链反应：连接酶链反应（ligase chain reaction，LCR）是一种探针扩增技术，又称连接酶扩增反应（ligase amplification），其扩增对象不是目标的DNA片段，而是引物组成的探针。④信号放大扩增技术：主要包括分支DNA（branch DNA，bDNA）信号放大系统和杂交捕获系统（hybrid capture），此外，PCR-酶联免疫反应（PCR-ELISA）也可用于核酸信号的放大。
二、利用核酸杂交或质谱分析检测细菌性病原体 ：
DNA杂交/探针分析（DNA-hybridization/probe assay）、荧光原位杂交（fluorescence in situ hybridization，FISH）、核酸肽-荧光原位杂交（peptide nucleic acid-FISH）、线性探针检测（line probe assay）、杂交保护测定（hybridization protection assay）、质谱分析法（mass spectrometry）。
三、利用多标记或通用靶标检测细菌性病原体：
多重PCR（multiplex PCR）、基因芯片/微阵列（gene chip/microarrays）、广范围PCR（broad-range PCR）。
