答:①假阴性:某些第一代直接核酸扩增检测(NAATs)会因为扩增抑制作用而导致试剂灵敏度的降低(如采用尿标本检测衣原体),从而引起假阴性结果,但这种抑制作用可通过内在监控或扩增控制等方法进行控制,也可以采用目标捕获等技术处理标本从而消除抑制作用;②假阳性:标本之间复制序列的残留物污染对直接核酸扩增检测可产生假阳性结果(注:非扩增直接核酸检测不受影响),需要严格执行操作程序以最大限度地减少残留物污染所带来的影响;③成本高:直接核酸扩增检测的成本通常高于传统微生物培养和EIA检测方法,衣原体、病毒的检测例外,其培养一般很难进行,而且成本要高于直接核酸扩增检测。

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