细菌16S rRNA基因广范围PCR扩增的引物主要有哪些?

细菌16S rRNA基因广范围PCR扩增的引物主要有哪些?扩增参数如何?

答:目前,16S rRNA基因的广范围引物序列已经公开(下表)。由于细菌16S rRNA基因的前500bp的变异较大,包含了丰富的种属信息,CLSI MM18-A建议采用4f-534r与27f-801r的引物组合进行PCR扩增和测序分析。但在一些科研究论文中,尤其是发表细菌新种的论文中,通常采用27f-1492r 或27f-1525r的引物组合进行广范围PCR扩增和测序。

细菌16S rRNA基因广谱PCR扩增的引物列表

细菌16S rRNA基因广谱PCR扩增的引物列表

细菌16S rRNA基因的PCR扩增参数基本如下:94℃ 5分钟;94℃ 1分钟,50~55℃ 1分钟,72℃ 1分钟,35个循环;72℃ 7分钟;4℃保温。

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