为什么16S rRNA基因测序可以在属或种水平鉴定细菌

答：16S rRNA基因是细菌染色体上编码rRNA相对应的DNA序列，存在于所有细菌的染色体基因组中，由保守区和可变区组成，两者互相交错排列。编码rRNA基因与细菌整个基因组的变化相比，有高度的保守性。现有细菌的RNA均由其祖先一代代传下来，虽然在长期的进化过程中，由于不时突变而有较大变化，但其祖先的某些痕迹仍留在其核苷酸序列中，这种痕迹为细菌的系统进化研究提供了可能。因此，有人将rRNA基因称为细菌的 “化石”。这一 “化石”的存在，为细菌的研究提供了方便。由于16S rRNA基因核苷酸序列总长度适宜，结构完整，更便于对细菌进行各种研究。设计一对引物，以16S rRNA基因为靶分子在适当条件下进行PCR扩增，便得到扩增后的16S rRNA基因片段，用链终止法或化学降解法对片段进行测序，并与基因库中的片段比对，便得知未知菌与基因库中其他菌的相似性，从而完成对菌的鉴定，其特征性的核苷酸序列是不同分类级别生物（如科、属、种）鉴定的分子基础。当鉴定同源性很高的菌种时，可以用生理生化实验或其他方法作为补充，但16S rRNA基因序列分析在分类学中的地位是无法代替的。