免疫PCR适用于样品量少和组分极低的成分检测
免疫PCR作为一种抗原检测系统，同时具有抗原抗体反应的高度特异性和PCR扩增产物的超敏感性，特别适用于各种样品量极少和组分含量极低的成分检测，并且可直接检测细胞膜上的抗原，已经应用于免疫学研究和临床诊断。免疫PCR技术已被用于测量DNA片段、各种微量激素（如TSH、HCG）、β-Gal、人原癌基因ETS1、血清和脑脊液中的肿瘤坏死因子α（TNF-α）、IL-3、IL-5、肿瘤相关抗原（GM3）、血浆中的α-人心钠素（α-hANP）、可溶性T细胞受体（sTCR）、胃癌相关抗原、血清可溶性细胞间黏附分子-1（sICAM-1）、乙型肝炎表面抗原（HBsAg）、牛单纯疱疹病毒1、人血清中的IL-18和各种分泌物中细菌产生的各种毒素等。实时免疫PCR被认为是蛋白质超微量测量的常规方法。
免疫PCR提高待测组分检测灵敏度
如Hendrickson等用夹心法免疫PCR检测hTSH的灵敏度为1fg（10-19 mol/L），而夹心法ELISA的最低检测限为1pg （10-16 mol/L），前者的检测灵敏度比后者高3个数量级；Lind等报道用实时定量免疫PCR检测前列腺特异性抗原（PSA）较ELISA更敏感；Saito等也证实，用免疫PCR检测健康人血清中的肿瘤坏死因子α（TNF-α）比ELISA的检测灵敏度高5×104倍；用夹心法免疫PCR技术检测重组HBsAg的检测限达15fg，比ELISA高1000倍；用免疫PCR检测人血清中的IL-18，其灵敏度是传统ELISA技术的1.6×104倍，ELISA的最低检测限为40ng/L，而免疫PCR为2.5pg/L。总之，免疫PCR的检测灵敏度比目前其他免疫分析法都要高103～105倍。研究证实，免疫PCR的检测灵敏度与引物序列DNA链的数目（单链或双链）及DNA长度、抗体浓度、PCR放大周期和PCR产物的测定方法密切相关，采用荧光化合物和酶等标记的引物进行PCR扩增，可进一步提高检测灵敏度。但免疫PCR存在的缺点是操作繁杂费时，为防止假阳性结果，实验洗涤必须充分完全，PCR扩增产物电泳时所用的染色剂EB有致癌作用和污染环境，电泳区带的定量分析影响因素多，精密度较差，而实时免疫PCR克服了上述缺点。
