- 临床上根据移植所用的造血干细胞来源，将造血干细胞移植分为骨髓干细胞移植、脐带血干细胞移植和外周血干细胞移植；
- 按照供体与受体的关系分为：自体骨髓移植/脐血移植/外周血造血干细胞移植，异体骨髓移植/脐血移植/外周血造血干细胞移植。异体移植又称异基因移植，当供者是同卵双生供者时，又称同基因移植；
- 根据供者与受者人类白细胞抗原（human leukocyte antigen，HLA）配型相合程度，异体骨髓移植/脐血移植/外周血造血干细胞移植又可以分为：HLA全相合移植、不全相合移植、单倍体相合移植；
- 根据供者与受者的血缘关系可以分为：血缘相关移植、非血缘移植即骨髓库来源供者；
- 根据移植前的预处理方案强度可分为：清髓性造血干细胞移植和非清髓性造血干细胞移植（减低预处理剂量的造血干细胞移植）。
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