乳腺癌基因组学
基因组学是研究基因组的结构、功能及表达产物的学科。由于基因组的产物包括蛋白质和许多复杂功能的RNA，因此其研究领域也包括3个不同的亚领域，即结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学。基因组学能为一些疾病提供新的诊断和治疗方法。例如，对刚诊断为乳腺癌的女性进行Oncotype DX检测，用来评估患者乳腺癌复发的个体危险度以及化疗效果，有助于医师获得更多的治疗信息并进行个体化用药。
乳腺癌基因组学是一门在基因组水平上研究乳腺癌发生发展过程各种结构和功能改变规律的学科。目前基因组学在乳腺癌基础研究和临床治疗方面的应用主要有以下内容：乳腺癌早期诊断或预后分子标记的筛选和鉴定；基因表达谱与临床表型的相关性；乳腺癌易感基因的筛查和鉴定；通过基因组研究发现新的乳腺癌治疗靶点。
乳腺癌蛋白质组学
蛋白质组是指细胞、组织或机体在特定的时间和空间上基因组所表达的全部蛋白质，是一个在时间和空间上变化的整体。蛋白质组学是研究细胞内所有蛋白质及其动态变化规律的科学，它是在蛋白质水平上定量、动态和整体地研究生物体，并由此在更深层次上获得对疾病过程、细胞生理和生化过程以及调控网络广泛而完整的认识。
从研究目标看，蛋白质组学可分为表达蛋白质组学和结构蛋白质组学，前者是对蛋白质功能模式（目前主要集中在蛋白质相互作用的网络关系）的研究，后者是对蛋白质表达模式（或蛋白质组的组成）的研究。研究流程大体可分为分离、鉴定、分析3个步骤。
蛋白质是基因的主要功能分子，也是医药工业重要的分子靶标，因此，对蛋白质组的研究受到广泛关注。蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同，对相关蛋白质进行分类和鉴定。传统的蛋白质研究注重研究单一蛋白质，而蛋白质组学注重研究参与特定生理或病理状态所有的蛋白质种类及其与周围环境的关系。双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱技术是蛋白质组学最常用的两大技术。蛋白质组学是一个迅速发展的领域，可以探索乳腺癌的异质性，同时从基因组中获得大量的信息。蛋白质组学为寻找与乳腺癌诊断和预后密切相关的特异性生物学标记、探讨乳腺癌的发生机制及早期临床治疗提供了技术研究平台。
